Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms