Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMYD4Q8IYR2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms