Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMNTD2Q8IXW0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms