Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PLD3Q8IV08 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms