Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUFY3Q7L099 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUFY3Q7L099 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms