Protein–RNA interactions for Protein: Q6VAB6

KSR2, Kinase suppressor of Ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR2Q6VAB6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KSR2Q6VAB6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KSR2Q6VAB6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms