Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD40Q6AI12 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms