Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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CTF1Q16619 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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CTF1Q16619 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTF1Q16619 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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CTF1Q16619 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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CTF1Q16619 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTF1Q16619 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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