Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDB1Q16531 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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