Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA4Q16363 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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