Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA3Q16281 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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