Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPAQ15257 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPAQ15257 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms