Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDCD1Q15116 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDCD1Q15116 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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