Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SQLEQ14534 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SQLEQ14534 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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