Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM25Q14258 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms