Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LAMB3Q13751 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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