Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PEX6Q13608 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms