Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKP2Q13309 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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