Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 INSR-205ENST00000598216 2961 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.543e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.883e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 INTS11-234ENST00000527383 668 ntTSL 314.39□□□□□ -0.118e-9■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 INTS11-214ENST00000470030 2369 ntTSL 513.67□□□□□ -0.228e-9■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 INTS11-213ENST00000467408 639 ntTSL 212.05□□□□□ -0.488e-9■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 HSD17B12-211ENST00000636007 563 ntTSL 417.79■□□□□ 0.442e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 HSD17B12-206ENST00000531185 611 ntTSL 416.32■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 HSD17B12-205ENST00000527433 559 ntTSL 414.38□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 AC068205.2-203ENST00000529261 748 ntTSL 39.71□□□□□ -0.862e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.272e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 HSD17B12-214ENST00000638034 546 ntTSL 54.32□□□□□ -1.722e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.735e-7■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 PLCL1-202ENST00000435320 6665 ntTSL 217.83■□□□□ 0.445e-7■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 PLCL1-205ENST00000487695 3083 ntTSL 56.75□□□□□ -1.335e-7■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.154e-7■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.154e-7■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 RPL22-204ENST00000465387 508 ntTSL 221.49■■□□□ 1.032e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 RPL22-206ENST00000480661 2279 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.72e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 RPL22-201ENST00000234875 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.82e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 RPL22-207ENST00000484532 449 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.082e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.272e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.372e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 PUM2-209ENST00000440577 4352 ntTSL 1 (best)6.2□□□□□ -1.422e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.482e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 RPL22-205ENST00000471204 524 ntTSL 24.2□□□□□ -1.742e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.312e-47■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 SF3B3-209ENST00000567635 630 ntTSL 56.89□□□□□ -1.313e-7■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 SF3B3-214ENST00000572365 575 ntTSL 45.02□□□□□ -1.613e-7■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 C16orf70-206ENST00000567162 695 ntTSL 53.27□□□□□ -1.893e-6■■■□□ 16.3
ILF3Q12906 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.154e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 BCL2L2-PABPN1-202ENST00000556100 655 ntTSL 313.39□□□□□ -0.274e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.374e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 ZMYND8-208ENST00000435836 670 ntTSL 58.72□□□□□ -1.013e-8■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.989e-7■■■□□ 16.2
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ILF3Q12906 MSH6-206ENST00000455383 578 ntTSL 518.68■□□□□ 0.581e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 MSH6-207ENST00000456246 846 ntTSL 317.83■□□□□ 0.441e-6■■■□□ 16.2
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ILF3Q12906 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.541e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.641e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.651e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 EZH2-210ENST00000498186 1876 ntTSL 223.51■■□□□ 1.355e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 EZH2-207ENST00000483012 1491 ntTSL 223.4■■□□□ 1.345e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.175e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.965e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.535e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.465e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.155e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 215.24■□□□□ 0.035e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.295e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 NBAS-208ENST00000442506 4391 ntTSL 1 (best)10.53□□□□□ -0.725e-9■■■□□ 16.2
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ILF3Q12906 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.265e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 NDUFAF2-202ENST00000502658 461 ntTSL 1 (best)5.48□□□□□ -1.535e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 CCAR1-203ENST00000479143 478 ntTSL 53.95□□□□□ -1.783e-7■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.193e-8■■■□□ 16.2
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ILF3Q12906 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -13e-8■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.273e-8■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 NCSTN-212ENST00000469159 856 ntTSL 27.95□□□□□ -1.143e-21■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.191e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.471e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.641e-6■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.195e-9■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 RBM39-217ENST00000448303 1008 ntTSL 54.26□□□□□ -1.733e-7■■■□□ 16.2
ILF3Q12906 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 326.58■■□□□ 1.851e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 DYRK1A-207ENST00000462274 1189 ntTSL 1 (best)25.39■■□□□ 1.661e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.361e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 SH2B1-209ENST00000563674 719 ntTSL 322.91■■□□□ 1.261e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 PSMD12-205ENST00000579365 560 ntTSL 419.95■□□□□ 0.782e-6■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.761e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.551e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 PSMD12-206ENST00000581618 613 ntTSL 418.25■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 PSMD12-208ENST00000584289 1090 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 PSMD12-207ENST00000584008 1752 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.211e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.131e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 TRIT1-209ENST00000486825 850 ntTSL 515.55■□□□□ 0.081e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 215.29■□□□□ 0.041e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.071e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.121e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 SH2B1-214ENST00000569471 791 ntTSL 314.25□□□□□ -0.131e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.211e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-8■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■■□□ 16.1
ILF3Q12906 TRIT1-201ENST00000316891 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.431e-8■■■□□ 16.1
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