Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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RAB40BQ12829 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB40BQ12829 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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