Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms