Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCN1BQ07699 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms