Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC10Q01780 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms