Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYBPC1Q00872 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms