Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUCB2P80303 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms