Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SPCS3P61009 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SPCS3P61009 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SPCS3P61009 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SPCS3P61009 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPCS3P61009 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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