Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP4CP60510 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4CP60510 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms