Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms