Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACVR1BP36896 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms