Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DMAP28067 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms