Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HRCP23327 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HRCP23327 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HRCP23327 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HRCP23327 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HRCP23327 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HRCP23327 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HRCP23327 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HRCP23327 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HRCP23327 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HRCP23327 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HRCP23327 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HRCP23327 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HRCP23327 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HRCP23327 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HRCP23327 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HRCP23327 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HRCP23327 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HRCP23327 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HRCP23327 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HRCP23327 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HRCP23327 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HRCP23327 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HRCP23327 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HRCP23327 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HRCP23327 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HRCP23327 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HRCP23327 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HRCP23327 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HRCP23327 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HRCP23327 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HRCP23327 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HRCP23327 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HRCP23327 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HRCP23327 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HRCP23327 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms