Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA6P23229 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms