Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A2P16615 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms