Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX4I1P13073 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I1P13073 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms