Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LYL1P12980 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LYL1P12980 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LYL1P12980 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms