Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHGAP10645 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHGAP10645 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHGAP10645 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHGAP10645 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHGAP10645 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHGAP10645 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHGAP10645 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHGAP10645 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHGAP10645 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHGAP10645 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHGAP10645 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHGAP10645 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHGAP10645 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHGAP10645 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHGAP10645 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHGAP10645 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHGAP10645 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHGAP10645 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHGAP10645 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHGAP10645 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHGAP10645 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms