Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM228BP0C875 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms