Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms