Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL18O94889 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL18O94889 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms