Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TIMM17BO60830 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms