Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP10AO60312 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms