Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KIAA0556O60303 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms