Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LANCL1O43813 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LANCL1O43813 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms