Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2K7ER74 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms