Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRDCB7Z8K6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms