Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8B2A6NJW9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms