Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF222A6NCQ9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF222A6NCQ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms