Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00862A6NCI5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms