Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL592227.1-201ENST00000614748 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 WT1-AS_1.1-201ENST00000619639 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMHD1-201ENST00000262878 4784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN29-201ENST00000396972 2831 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NTPCR-202ENST00000366628 6311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NIPAL1-201ENST00000295461 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO5A-202ENST00000358212 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO5A-205ENST00000399231 12225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO5A-206ENST00000399233 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMEF8-201ENST00000357367 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf116-201ENST00000359470 5493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A14-202ENST00000448498 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR47-205ENST00000400794 4134 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM47A-201ENST00000346193 2556 ntAPPRIS P2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH1-214ENST00000621016 3304 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EPSTI1-201ENST00000313624 3114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SYVN1-206ENST00000526060 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF185-202ENST00000318529 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DMD-212ENST00000378723 4645 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG6-203ENST00000367608 6879 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRB3-204ENST00000541819 5934 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL3-202ENST00000396429 2707 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR3G-201ENST00000399107 3285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ADIPOQ-201ENST00000320741 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TBCEL-202ENST00000422003 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ABI1-209ENST00000376166 3441 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EFCAB8-201ENST00000400522 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGAX-203ENST00000562522 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRP4-202ENST00000426920 2650 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM17-201ENST00000310823 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA5-201ENST00000273854 8266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS7P3-201ENST00000566116 3716 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMD1-201ENST00000308696 3326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM105-201ENST00000332900 3321 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ARMC8-221ENST00000491704 2777 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3TC2-211ENST00000512049 4002 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PITRM1-202ENST00000380989 3487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A11-209ENST00000567758 2246 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MST1R-202ENST00000344206 4198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC144CP-202ENST00000433419 5227 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF215-201ENST00000278319 3448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NOD2-201ENST00000300589 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DAB1-206ENST00000414851 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CLIP1-202ENST00000358808 5880 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms