Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ALKQ9UM73 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALKQ9UM73 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms